19. 分位数相关:定义、QQ图(Quantile-Quantile Plots)、分位数标准化(Quantile Normalization)
- 分位数(quantile)定义:能把数据分成数量相等组的线。例如中位数50%median,将数据分为相等数量的组。0.25分位数,0.75分位数(1/15分位数点)。R语言中
quantile()
多种方法结果有略微差异。数据量小不用纠结
想知道数据更接近哪一种分布,可以使用QQ图展示。
纵坐标为实际数据的分布,横坐标为预估分布的对应分位数点。看两者是否相吻合。分位数标准化:例如用再芯片数据中对 去除技术误差(technical difference)(两个批次的仪器对数据产生的影响)、或者两组RNA-seq表达量数据的标准化。
- 分位数标准化的过程:
- 分位数标准化的过程:
标准化之后的数据有相同的四分位数。并保留了每组的顺序高低。