Phylogenomic_Tutorial_IntrogressionDetection_with_SNP
Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【十一】：利用SNP数据鉴定渐渗introgression和杂交hybridization。
Tianpeng Wang
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Phylogenomic-Tutorial-SpeciesTree-with-SNP
Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【八】：利用SNP数据，SVDQuatets软件去推断物种树species tree
Phylogenomic_Tutorial_DivergenceTime_with_SNP
Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【九】：利用SNP数据，SNAPP软件去推断物种树species tree及分化时间。
Phylogenomic_Tutorial || Local Assembly of specific orthologs
Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【七】：定向对新测序物种的orthologs进行组装
Phylogenomic_Tutorial || Bayesian Species Tree Inference
Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【六】利用BEAST2构建贝叶斯法的系统树及基础分化时间的推断
Phylogenomic_Tutorial || SpeciesTree Inference by ML
Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【五】：利用直系同源基因orthologs去推断物种树species tree。
Phylogenomic_Tutorial || Ortholog Detection
Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【四】：物种树推断首先需要找物种间的直系同源基因orthologs。
Phylogenomic_Tutorial || Divergence Time Estimation
Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【三】利用化石证据的贝叶斯系统分化时间推断
Phylogenomic_Tutorial || Bayesian Phylogenetic Inference
Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【二】贝叶斯树的构建及基础贝叶斯分化时间推断
Phylogenomic_Tutorial || ML_Tree inference
Github/mmatschiner的phylogenetic & phylogenomic学习教程记录【一】多序列比对；核算替换模型的选择；最大似然法建树的学习